El trabajo de la Cátedra de Cultura Científica de la UPV/EHU ha sido reconocido por distintas entidades:
Premio Prismas
Los Prismas son una iniciativa de los Museos Científicos Coruñeses (Ayuntamiento de A Coruña) para premiar la difusión de la cultura científica, y también para apoyar a profesionales que trabajan en este campo. Son el reconocimiento más importante a la divulgación científica en el estado. El Premio Especial es una de las categorías de estos premios y se concede a entidades que han destacado de forma especial por su labor en el ámbito de la divulgación científica.
La Cátedra de Cultura Científica de la UPV/EHU obtuvo el premio Prismas, en la categoría especial, en 2014.
Premio Buber
Los Premios Buber se otorgan a las mejores webs o aplicaciones móviles vascas desde el año 2000. Buber es el apodo de internet de Blas Pedro Uberuaga, físico que creó en 1994 la primera página web dedicada al País Vasco.
El blog Mujeres con Ciencia obtuvo el premio Buber 2017.
Premio 8 de marzo del Ayuntamiento de Getafe
Los premios, organizados por el Ayuntamiento de Getafe, buscan reconocer el trabajo a favor de la igualdad real de las personas.
El blog Mujeres con Ciencia obtuvo una mención especial en 2017.
Premio NovaGob excelencia
Los premios, organizados por la fundación Novagob, premian los proyectos más innovadores de entidades y personas del sector público iberoamericano.
El blog Mujeres con Ciencia obtuvo el Premio NovaGob 2018 a la Excelencia en igualdad de género.
Reconocimiento a su labor en el ámbito del euskera y la cultura vasca
Se trata de un reconocimiento otorgado por la UPV/EHU por la labor en el ámbito del euskera y la cultura vasca.
La Cátedra de Cultura Científica de la Universidad del País Vasco obtuvo el reconocimiento en 2023.
Premio Zirgari
Los premios Zirgari, entregados por la Diputación Foral de Bizkaia y BBK, reivindican los avances en igualdad.
El bloga Mujeres con Ciencia recibió el premio Zirgari en 2024.